Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps4aQ8VEJ9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms