Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stx18Q8VDS8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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