Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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