Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn4Q8VCH8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn4Q8VCH8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms