Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Dnajc28Q8VCE1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnajc28Q8VCE1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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