Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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