Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lin28aQ8K3Y3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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