Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OptnQ8K3K8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms