Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms