Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms