Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms