Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFP6

Dnajc27, DnaJ homolog subfamily C member 27, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc27Q8CFP6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnajc27Q8CFP6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms