Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Snx8Q8CFD4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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