Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp27Q8CEG8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms