Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam228aQ8CDW1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Fam228aQ8CDW1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam228aQ8CDW1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam228aQ8CDW1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Fam228aQ8CDW1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam228aQ8CDW1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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