Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc178Q8CDV0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc178Q8CDV0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms