Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Lrrc9Q8CDN9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc9Q8CDN9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Lrrc9Q8CDN9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms