Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ssuh2Q8C3L1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ssuh2Q8C3L1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ssuh2Q8C3L1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ssuh2Q8C3L1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ssuh2Q8C3L1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ssuh2Q8C3L1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ssuh2Q8C3L1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ssuh2Q8C3L1 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssuh2Q8C3L1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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