Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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