Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtpaQ8BWP5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtpaQ8BWP5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms