Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4aQ8BW72 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms