Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms