Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip4Q8BQP8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms