Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Smarcal1Q8BJL0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Smarcal1Q8BJL0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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