Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms