Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco3Q8BH01 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmco3Q8BH01 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms