Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms