Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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