Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms