Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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