Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms