Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nek5Q7TSC3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms