Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actn1Q7TPR4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Actn1Q7TPR4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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