Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmed3Q78IS1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms