Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme8Q715T0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms