Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssxb10Q6XAR7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb10Q6XAR7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms