Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zbtb40Q6PCS8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Zbtb40Q6PCS8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Zbtb40Q6PCS8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Zbtb40Q6PCS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Zbtb40Q6PCS8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Zbtb40Q6PCS8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Zbtb40Q6PCS8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms