Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
BC061212Q6P8K3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms