Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Smchd1Q6P5D8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smchd1Q6P5D8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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