Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd7bQ6P4U0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms