Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mvb12bQ6KAU4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mvb12bQ6KAU4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mvb12bQ6KAU4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mvb12bQ6KAU4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mvb12bQ6KAU4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mvb12bQ6KAU4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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