Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CltbQ6IRU5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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