Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpm4Q6IRU2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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