Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg9bQ6EBV9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms