Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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