Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg9aQ68FE2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atg9aQ68FE2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atg9aQ68FE2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms