Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltcQ68FD5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms