Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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