Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Top2bQ64511 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms