Protein–RNA interactions for Protein: Q64364

Cdkn2a, Tumor suppressor ARF, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aQ64364 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cdkn2aQ64364 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cdkn2aQ64364 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cdkn2aQ64364 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cdkn2aQ64364 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cdkn2aQ64364 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cdkn2aQ64364 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkn2aQ64364 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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